MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 2

Total Repeats: 2691

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011988	CAT	2	6	1180963	1180968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_011988	ACC	2	6	1180992	1180997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2503	NC_011988	GC	3	6	1181015	1181020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2504	NC_011988	CGC	4	12	1181018	1181029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_011988	TGG	2	6	1181037	1181042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_011988	CTG	2	6	1181123	1181128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_011988	GAT	2	6	1181129	1181134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_011988	TGC	2	6	1181191	1181196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_011988	AGA	2	6	1181304	1181309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_011988	GGC	2	6	1181341	1181346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_011988	TGC	2	6	1183233	1183238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_011988	GAA	2	6	1183256	1183261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_011988	CGG	2	6	1183323	1183328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_011988	T	6	6	1183376	1183381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_011988	GCG	2	6	1186327	1186332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_011988	GGTG	2	8	1186467	1186474	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_011988	TGCC	2	8	1186502	1186509	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_011988	TGG	2	6	1186567	1186572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_011988	ATT	2	6	1186667	1186672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_011988	GTG	2	6	1186697	1186702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_011988	TGC	2	6	1186723	1186728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_011988	TGG	2	6	1186767	1186772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_011988	TGA	2	6	1186863	1186868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_011988	GACA	2	8	1187010	1187017	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2525	NC_011988	CGG	2	6	1187513	1187518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_011988	C	6	6	1187519	1187524	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2527	NC_011988	A	6	6	1187529	1187534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_011988	T	6	6	1187563	1187568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_011988	TCA	2	6	1193539	1193544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_011988	GGT	2	6	1194060	1194065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_011988	CGG	2	6	1201243	1201248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_011988	TTTG	2	8	1201267	1201274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_011988	TGGCG	2	10	1201277	1201286	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2534	NC_011988	CT	3	6	1203526	1203531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2535	NC_011988	AT	3	6	1203532	1203537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_011988	CT	3	6	1203579	1203584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2537	NC_011988	GTT	2	6	1205579	1205584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_011988	TTCT	2	8	1205598	1205605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2539	NC_011988	CAA	2	6	1205688	1205693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2540	NC_011988	A	6	6	1205730	1205735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_011988	GGAGC	2	10	1206356	1206365	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2542	NC_011988	GCC	2	6	1206381	1206386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2543	NC_011988	CGG	2	6	1206437	1206442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_011988	CCG	2	6	1206582	1206587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2545	NC_011988	A	6	6	1206623	1206628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_011988	TCCA	2	8	1206760	1206767	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2547	NC_011988	CGG	2	6	1206801	1206806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_011988	TGA	2	6	1206811	1206816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_011988	TGT	2	6	1206853	1206858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_011988	CGG	2	6	1206935	1206940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2551	NC_011988	ACC	2	6	1207444	1207449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_011988	ACA	2	6	1207477	1207482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2553	NC_011988	GCC	2	6	1207502	1207507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2554	NC_011988	CGGA	2	8	1207523	1207530	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2555	NC_011988	GC	3	6	1207572	1207577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2556	NC_011988	GCG	2	6	1207583	1207588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_011988	AG	3	6	1207596	1207601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_011988	T	7	7	1208811	1208817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_011988	AGT	2	6	1208894	1208899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_011988	TTA	2	6	1208942	1208947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2562	NC_011988	AGGGG	2	10	1209074	1209083	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_011988	GCT	2	6	1209116	1209121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2564	NC_011988	GCC	2	6	1209937	1209942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_011988	AGC	3	9	1214149	1214157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2567	NC_011988	AGGAT	2	10	1214177	1214186	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_011988	T	6	6	1214193	1214198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_011988	TCA	2	6	1214213	1214218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2570	NC_011988	AT	3	6	1214298	1214303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_011988	CCT	2	6	1214304	1214309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2572	NC_011988	GTT	2	6	1214313	1214318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_011988	GTG	2	6	1214427	1214432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_011988	AAT	2	6	1214449	1214454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_011988	TGGC	2	8	1214479	1214486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2576	NC_011988	A	6	6	1214531	1214536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_011988	TA	3	6	1214574	1214579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2579	NC_011988	GCG	2	6	1216018	1216023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_011988	GCC	2	6	1216852	1216857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2583	NC_011988	GCTTG	2	10	1217476	1217485	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2584	NC_011988	AAG	2	6	1217538	1217543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2587	NC_011988	TGG	2	6	1218401	1218406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_011988	A	6	6	1218430	1218435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_011988	CAAA	2	8	1219976	1219983	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2593	NC_011988	TG	3	6	1221621	1221626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_011988	GAT	2	6	1221654	1221659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2597	NC_011988	TGCA	2	8	1225722	1225729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2598	NC_011988	AAAT	2	8	1225937	1225944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_011988	AT	3	6	1225950	1225955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_011988	AGG	2	6	1226293	1226298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_011988	TGA	2	6	1226302	1226307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_011988	TTG	2	6	1226311	1226316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_011988	GCC	2	6	1226454	1226459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2605	NC_011988	GAAAA	2	10	1226494	1226503	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_011988	T	6	6	1230471	1230476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_011988	AAT	2	6	1230508	1230513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_011988	TCT	2	6	1230524	1230529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_011988	A	6	6	1230562	1230567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_011988	A	6	6	1230582	1230587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_011988	T	7	7	1230623	1230629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_011988	TAT	2	6	1230632	1230637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_011988	AATA	2	8	1230649	1230656	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_011988	GC	4	8	1230700	1230707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_011988	TGA	2	6	1230713	1230718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_011988	GGT	2	6	1230739	1230744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2618	NC_011988	AAAT	2	8	1230832	1230839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_011988	CAA	2	6	1233834	1233839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2621	NC_011988	TTTG	2	8	1235121	1235128	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_011988	GC	3	6	1238853	1238858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2623	NC_011988	GGC	2	6	1238903	1238908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2627	NC_011988	AAT	2	6	1239546	1239551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_011988	GGTT	2	8	1239954	1239961	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_011988	TCC	2	6	1241615	1241620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2630	NC_011988	GCC	2	6	1245106	1245111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2631	NC_011988	AGAGA	2	10	1246373	1246382	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_011988	TGG	2	6	1247566	1247571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_011988	CGC	2	6	1247584	1247589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2634	NC_011988	TCC	2	6	1247592	1247597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2635	NC_011988	G	6	6	1247627	1247632	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_011988	CCT	2	6	1248389	1248394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2637	NC_011988	ATA	3	9	1248544	1248552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2638	NC_011988	AGT	2	6	1248556	1248561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_011988	GGTA	2	8	1248563	1248570	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2640	NC_011988	GAG	2	6	1248577	1248582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2641	NC_011988	CA	3	6	1253167	1253172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2642	NC_011988	CGA	2	6	1253202	1253207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2643	NC_011988	CGTT	2	8	1253243	1253250	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2644	NC_011988	GCG	2	6	1253259	1253264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2645	NC_011988	TAGA	2	8	1253294	1253301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2646	NC_011988	AAC	2	6	1253612	1253617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2647	NC_011988	A	8	8	1253628	1253635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2648	NC_011988	GGCGC	2	10	1253650	1253659	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2649	NC_011988	CTT	2	6	1253686	1253691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2650	NC_011988	GGC	2	6	1253694	1253699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2651	NC_011988	GGA	2	6	1253743	1253748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2652	NC_011988	TAAA	2	8	1253800	1253807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2653	NC_011988	TAA	2	6	1253810	1253815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2654	NC_011988	TCC	2	6	1255951	1255956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2655	NC_011988	TCC	2	6	1258102	1258107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2656	NC_011988	GT	3	6	1258180	1258185	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2657	NC_011988	AGG	2	6	1258286	1258291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2658	NC_011988	AAC	2	6	1259159	1259164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2659	NC_011988	CAG	2	6	1260163	1260168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2660	NC_011988	CGG	2	6	1260201	1260206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2661	NC_011988	GCC	2	6	1260212	1260217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2662	NC_011988	GTTTGC	2	12	1265577	1265588	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2663	NC_011988	GGT	3	9	1265606	1265614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2664	NC_011988	GGGC	2	8	1266544	1266551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2665	NC_011988	GC	3	6	1266619	1266624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2666	NC_011988	CCCG	2	8	1266637	1266644	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2667	NC_011988	T	7	7	1266660	1266666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2668	NC_011988	ATC	2	6	1266677	1266682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2669	NC_011988	T	7	7	1266719	1266725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2670	NC_011988	CAT	2	6	1266732	1266737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2671	NC_011988	AAG	2	6	1266744	1266749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2672	NC_011988	GTC	2	6	1271184	1271189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2673	NC_011988	GTC	2	6	1273772	1273777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2674	NC_011988	CATT	2	8	1273811	1273818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2675	NC_011988	AGGC	2	8	1273894	1273901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2676	NC_011988	GA	3	6	1274739	1274744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2677	NC_011988	GCG	2	6	1274793	1274798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2678	NC_011988	TCG	2	6	1274835	1274840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2680	NC_011988	CTG	2	6	1275802	1275807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2681	NC_011988	CGG	2	6	1275827	1275832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2682	NC_011988	ATC	2	6	1275861	1275866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2683	NC_011988	GCG	2	6	1275884	1275889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2684	NC_011988	GCTG	2	8	1275961	1275968	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2691	NC_011988	GC	3	6	1281009	1281014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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